Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN2A-AS1Q9UH64 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN2A-AS1Q9UH64 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms