Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDRG3Q9UGV2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDRG3Q9UGV2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG3Q9UGV2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms