Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRODH2Q9UF12 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRODH2Q9UF12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRODH2Q9UF12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRODH2Q9UF12 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms