Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEF1Q9UBV8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEF1Q9UBV8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEF1Q9UBV8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEF1Q9UBV8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms