Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3KQ9UBQ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3KQ9UBQ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3KQ9UBQ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms