Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL13Q9P2N7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL13Q9P2N7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL13Q9P2N7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms