Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCDH10Q9P2E7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PCDH10Q9P2E7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCDH10Q9P2E7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDH10Q9P2E7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCDH10Q9P2E7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms