Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms