Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF4Q9P032 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFAF4Q9P032 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDUFAF4Q9P032 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFAF4Q9P032 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF4Q9P032 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDUFAF4Q9P032 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFAF4Q9P032 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.7 ms