Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GGA3Q9NZ52 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GGA3Q9NZ52 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GGA3Q9NZ52 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GGA3Q9NZ52 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GGA3Q9NZ52 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GGA3Q9NZ52 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GGA3Q9NZ52 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GGA3Q9NZ52 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GGA3Q9NZ52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GGA3Q9NZ52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GGA3Q9NZ52 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GGA3Q9NZ52 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GGA3Q9NZ52 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GGA3Q9NZ52 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GGA3Q9NZ52 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GGA3Q9NZ52 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GGA3Q9NZ52 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms