Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSD3Q9NYI0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSD3Q9NYI0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSD3Q9NYI0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSD3Q9NYI0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSD3Q9NYI0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSD3Q9NYI0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSD3Q9NYI0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSD3Q9NYI0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSD3Q9NYI0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSD3Q9NYI0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSD3Q9NYI0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PSD3Q9NYI0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.4 ms