Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM53CQ9NYF3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM53CQ9NYF3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM53CQ9NYF3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM53CQ9NYF3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM53CQ9NYF3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM53CQ9NYF3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM53CQ9NYF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM53CQ9NYF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM53CQ9NYF3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM53CQ9NYF3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM53CQ9NYF3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM53CQ9NYF3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM53CQ9NYF3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM53CQ9NYF3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms