Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PPP4R2Q9NY27 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PPP4R2Q9NY27 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPP4R2Q9NY27 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPP4R2Q9NY27 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPP4R2Q9NY27 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPP4R2Q9NY27 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPP4R2Q9NY27 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPP4R2Q9NY27 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPP4R2Q9NY27 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPP4R2Q9NY27 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPP4R2Q9NY27 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPP4R2Q9NY27 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPP4R2Q9NY27 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPP4R2Q9NY27 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPP4R2Q9NY27 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPP4R2Q9NY27 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPP4R2Q9NY27 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPP4R2Q9NY27 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPP4R2Q9NY27 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PPP4R2Q9NY27 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPP4R2Q9NY27 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PPP4R2Q9NY27 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPP4R2Q9NY27 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms