Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX18Q9NVP1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX18Q9NVP1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX18Q9NVP1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 332.5 ms