Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCND1Q9NSA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCND1Q9NSA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCND1Q9NSA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCND1Q9NSA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCND1Q9NSA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCND1Q9NSA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCND1Q9NSA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KCND1Q9NSA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCND1Q9NSA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCND1Q9NSA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCND1Q9NSA2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCND1Q9NSA2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCND1Q9NSA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCND1Q9NSA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCND1Q9NSA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCND1Q9NSA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCND1Q9NSA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCND1Q9NSA2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KCND1Q9NSA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCND1Q9NSA2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCND1Q9NSA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms