Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC2Q9NRP2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC2Q9NRP2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC2Q9NRP2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC2Q9NRP2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMC2Q9NRP2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMC2Q9NRP2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMC2Q9NRP2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275 ms