Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG1

PRTFDC1, Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTFDC1Q9NRG1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRTFDC1Q9NRG1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRTFDC1Q9NRG1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRTFDC1Q9NRG1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRTFDC1Q9NRG1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRTFDC1Q9NRG1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRTFDC1Q9NRG1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRTFDC1Q9NRG1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRTFDC1Q9NRG1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRTFDC1Q9NRG1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRTFDC1Q9NRG1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRTFDC1Q9NRG1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRTFDC1Q9NRG1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRTFDC1Q9NRG1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms