Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCB6Q9NP58 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB6Q9NP58 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB6Q9NP58 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ABCB6Q9NP58 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCB6Q9NP58 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms