Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC4CQ9HCJ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC4CQ9HCJ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC4CQ9HCJ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC4CQ9HCJ2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC4CQ9HCJ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC4CQ9HCJ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4CQ9HCJ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4CQ9HCJ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC4CQ9HCJ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC4CQ9HCJ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC4CQ9HCJ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms