Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.56■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POPDC2Q9HBU9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POPDC2Q9HBU9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POPDC2Q9HBU9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POPDC2Q9HBU9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POPDC2Q9HBU9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms