Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMURF2Q9HAU4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMURF2Q9HAU4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMURF2Q9HAU4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMURF2Q9HAU4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms