Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NHEJ1Q9H9Q4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NHEJ1Q9H9Q4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NHEJ1Q9H9Q4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NHEJ1Q9H9Q4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHEJ1Q9H9Q4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHEJ1Q9H9Q4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHEJ1Q9H9Q4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHEJ1Q9H9Q4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHEJ1Q9H9Q4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NHEJ1Q9H9Q4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NHEJ1Q9H9Q4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHEJ1Q9H9Q4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHEJ1Q9H9Q4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHEJ1Q9H9Q4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NHEJ1Q9H9Q4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHEJ1Q9H9Q4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHEJ1Q9H9Q4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHEJ1Q9H9Q4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHEJ1Q9H9Q4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHEJ1Q9H9Q4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHEJ1Q9H9Q4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHEJ1Q9H9Q4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHEJ1Q9H9Q4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHEJ1Q9H9Q4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHEJ1Q9H9Q4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHEJ1Q9H9Q4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHEJ1Q9H9Q4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHEJ1Q9H9Q4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NHEJ1Q9H9Q4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHEJ1Q9H9Q4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms