Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7P6

MVB12B, Multivesicular body subunit 12B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12BQ9H7P6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MVB12BQ9H7P6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MVB12BQ9H7P6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MVB12BQ9H7P6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MVB12BQ9H7P6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MVB12BQ9H7P6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MVB12BQ9H7P6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MVB12BQ9H7P6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MVB12BQ9H7P6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MVB12BQ9H7P6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MVB12BQ9H7P6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MVB12BQ9H7P6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MVB12BQ9H7P6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MVB12BQ9H7P6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MVB12BQ9H7P6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MVB12BQ9H7P6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MVB12BQ9H7P6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MVB12BQ9H7P6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MVB12BQ9H7P6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MVB12BQ9H7P6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms