Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms