Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXO5Q9H790 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXO5Q9H790 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXO5Q9H790 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXO5Q9H790 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms