Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNDC4Q9H6D8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FNDC4Q9H6D8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC4Q9H6D8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms