Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMOC1Q9H4F8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMOC1Q9H4F8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMOC1Q9H4F8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMOC1Q9H4F8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMOC1Q9H4F8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMOC1Q9H4F8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMOC1Q9H4F8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMOC1Q9H4F8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMOC1Q9H4F8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMOC1Q9H4F8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMOC1Q9H4F8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMOC1Q9H4F8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMOC1Q9H4F8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms