Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P7

ACBD3, Golgi resident protein GCP60, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD3Q9H3P7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD3Q9H3P7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACBD3Q9H3P7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACBD3Q9H3P7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACBD3Q9H3P7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACBD3Q9H3P7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ACBD3Q9H3P7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACBD3Q9H3P7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACBD3Q9H3P7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACBD3Q9H3P7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACBD3Q9H3P7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACBD3Q9H3P7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACBD3Q9H3P7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACBD3Q9H3P7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD3Q9H3P7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ACBD3Q9H3P7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACBD3Q9H3P7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACBD3Q9H3P7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACBD3Q9H3P7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms