Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHCBP1LQ9BZQ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHCBP1LQ9BZQ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHCBP1LQ9BZQ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SHCBP1LQ9BZQ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHCBP1LQ9BZQ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms