Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CELF4Q9BZC1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CELF4Q9BZC1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CELF4Q9BZC1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CELF4Q9BZC1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CELF4Q9BZC1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF4Q9BZC1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CELF4Q9BZC1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CELF4Q9BZC1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CELF4Q9BZC1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms