Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC0

HCAR1, Hydroxycarboxylic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR1Q9BXC0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCAR1Q9BXC0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCAR1Q9BXC0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCAR1Q9BXC0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCAR1Q9BXC0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCAR1Q9BXC0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms