Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BRIP1Q9BX63 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BRIP1Q9BX63 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BRIP1Q9BX63 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BRIP1Q9BX63 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BRIP1Q9BX63 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BRIP1Q9BX63 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRIP1Q9BX63 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
BRIP1Q9BX63 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
BRIP1Q9BX63 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BRIP1Q9BX63 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BRIP1Q9BX63 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRIP1Q9BX63 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BRIP1Q9BX63 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BRIP1Q9BX63 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BRIP1Q9BX63 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRIP1Q9BX63 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRIP1Q9BX63 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRIP1Q9BX63 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRIP1Q9BX63 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BRIP1Q9BX63 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
BRIP1Q9BX63 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BRIP1Q9BX63 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BRIP1Q9BX63 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BRIP1Q9BX63 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BRIP1Q9BX63 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BRIP1Q9BX63 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
BRIP1Q9BX63 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BRIP1Q9BX63 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
BRIP1Q9BX63 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRIP1Q9BX63 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRIP1Q9BX63 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRIP1Q9BX63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRIP1Q9BX63 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRIP1Q9BX63 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRIP1Q9BX63 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRIP1Q9BX63 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRIP1Q9BX63 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRIP1Q9BX63 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms