Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED9Q9BVK6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED9Q9BVK6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED9Q9BVK6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMED9Q9BVK6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms