Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP250Q9BV73 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP250Q9BV73 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP250Q9BV73 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP250Q9BV73 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP250Q9BV73 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP250Q9BV73 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP250Q9BV73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP250Q9BV73 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP250Q9BV73 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP250Q9BV73 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP250Q9BV73 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP250Q9BV73 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CEP250Q9BV73 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP250Q9BV73 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP250Q9BV73 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP250Q9BV73 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP250Q9BV73 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP250Q9BV73 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP250Q9BV73 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP250Q9BV73 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP250Q9BV73 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP250Q9BV73 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms