Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSRP1Q9BUV0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSRP1Q9BUV0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RSRP1Q9BUV0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RSRP1Q9BUV0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSRP1Q9BUV0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms