Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT92

TCHP, Trichoplein keratin filament-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCHPQ9BT92 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCHPQ9BT92 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCHPQ9BT92 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TCHPQ9BT92 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCHPQ9BT92 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCHPQ9BT92 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCHPQ9BT92 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCHPQ9BT92 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TCHPQ9BT92 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCHPQ9BT92 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCHPQ9BT92 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCHPQ9BT92 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCHPQ9BT92 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TCHPQ9BT92 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCHPQ9BT92 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCHPQ9BT92 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms