Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCM2Q9BSQ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCM2Q9BSQ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCM2Q9BSQ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCM2Q9BSQ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCM2Q9BSQ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms