Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIKE1Q9BRV8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIKE1Q9BRV8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIKE1Q9BRV8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIKE1Q9BRV8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIKE1Q9BRV8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIKE1Q9BRV8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SIKE1Q9BRV8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms