Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI9

NRIP2, Nuclear receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP2Q9BQI9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NRIP2Q9BQI9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP2Q9BQI9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP2Q9BQI9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms