Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPA33Q99795 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPA33Q99795 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPA33Q99795 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPA33Q99795 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPA33Q99795 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPA33Q99795 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPA33Q99795 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPA33Q99795 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPA33Q99795 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPA33Q99795 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPA33Q99795 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPA33Q99795 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPA33Q99795 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPA33Q99795 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPA33Q99795 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPA33Q99795 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPA33Q99795 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPA33Q99795 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPA33Q99795 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms