Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGREF1Q99674 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGREF1Q99674 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CGREF1Q99674 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGREF1Q99674 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGREF1Q99674 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms