Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL2Q96S94 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL2Q96S94 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL2Q96S94 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL2Q96S94 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 415.6 ms