Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARXQ96QS3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARXQ96QS3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARXQ96QS3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARXQ96QS3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARXQ96QS3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms