Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD11Q96NU1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD11Q96NU1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD11Q96NU1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD11Q96NU1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD11Q96NU1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD11Q96NU1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD11Q96NU1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD11Q96NU1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD11Q96NU1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD11Q96NU1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD11Q96NU1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD11Q96NU1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD11Q96NU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD11Q96NU1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD11Q96NU1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD11Q96NU1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD11Q96NU1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD11Q96NU1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD11Q96NU1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD11Q96NU1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD11Q96NU1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD11Q96NU1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.2 ms