Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCMTD1Q96MG8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCMTD1Q96MG8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PCMTD1Q96MG8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCMTD1Q96MG8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PCMTD1Q96MG8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms