Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf66Q96MD2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf66Q96MD2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf66Q96MD2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf66Q96MD2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C12orf66Q96MD2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C12orf66Q96MD2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C12orf66Q96MD2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C12orf66Q96MD2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C12orf66Q96MD2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C12orf66Q96MD2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf66Q96MD2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf66Q96MD2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf66Q96MD2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms