Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARK4Q96L34 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARK4Q96L34 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARK4Q96L34 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARK4Q96L34 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARK4Q96L34 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MARK4Q96L34 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARK4Q96L34 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARK4Q96L34 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK4Q96L34 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK4Q96L34 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARK4Q96L34 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARK4Q96L34 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARK4Q96L34 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms