Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSANTD3Q96H12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MSANTD3Q96H12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSANTD3Q96H12 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSANTD3Q96H12 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSANTD3Q96H12 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSANTD3Q96H12 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSANTD3Q96H12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSANTD3Q96H12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSANTD3Q96H12 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSANTD3Q96H12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSANTD3Q96H12 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MSANTD3Q96H12 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSANTD3Q96H12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSANTD3Q96H12 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms