Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEH1LQ96EE3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEH1LQ96EE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEH1LQ96EE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEH1LQ96EE3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEH1LQ96EE3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEH1LQ96EE3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEH1LQ96EE3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEH1LQ96EE3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEH1LQ96EE3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEH1LQ96EE3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEH1LQ96EE3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEH1LQ96EE3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEH1LQ96EE3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEH1LQ96EE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms