Protein–RNA interactions for Protein: Q96D42

HAVCR1, Hepatitis A virus cellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR1Q96D42 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HAVCR1Q96D42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAVCR1Q96D42 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HAVCR1Q96D42 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms